正享受短暫假期的公(?)安(ān )九課少校草薙素子（坂本真綾 配音）突然接到(dào )巴特(tè )（松田健一郎 配音）的報(bào)(bào )告，西之內(nèi)某處大廈遭受恐怖(??)分子襲擊(jī )，政府高官和商(??)業(yè)巨擎被人殺害(hài )。在草(??)薙的指揮下，九課的(de )石川、波瑪(mǎ )、帕茲、巴(??)特等人通力合作，將恐怖分子(??)徹底制服，但(dàn )草薙在行動(dòng)中意外受到神秘病毒感染。在(zài )西之內(nèi)恐怖(bù )襲擊的同時(shí)，遠(yuǎn)郊的水壩發(fā)生爆炸案。新濱縣刑警陀古薩（新垣(??)樽助 配音）傳喚水壩管理企業(yè)負(fù)責(zé)人沙特博士，對(duì)方是(??)來(lái)自飽經(jīng)戰(zhàn)火的卡(kǎ )森共和國(guó)的卡爾迪斯人。受(shòu )警方高層施壓，陀(??)古(??)薩沒(méi)有得到任何有(yǒu )用信息。另(lìng )一方面，草薙一方得知恐怖(??)分(??)子的真實(shí)身份，正是卡爾迪斯的游擊隊(duì)組織。兩起案件意外聯(lián)系在一起，其背后隱藏怎樣的真相？　　本(??)片根(??)據(jù)士郎正宗的原作改編，為(??)攻殼機(jī)動(dòng)隊(duì)前傳“ARISE”的第三部?！?/div>