在第二次新吉恩戰(zhàn)爭、別名“夏亞的叛亂”終結(jié)后，地球圈取得了短暫的(de )和平?！　∵@之后3年，宇(yǔ )宙世(??)紀(jì)(jì )0096年。在工業(yè)殖(?)民地“工業(yè)7號”上進行了(le )一(yī )(??)項秘密交涉。內(nèi)(nèi )容為－－被認為是地球(??)聯(lián)邦政府暗中操控(??)的“比斯特財團”將把最(zuì )高機密“拉(lā )(??)普拉斯之箱”交給新吉恩的殘(??)黨軍“袖付”?！　×硪环矫妫诎布{海姆工業(yè)專(??)門學(xué)校就讀的少年(?)巴納吉·林克斯(sī )遇見了自稱為奧黛麗·本的(de )少女（(??)實為(wéi )舊吉恩公國次男多茲魯·扎比之女，美耐(??)巴(bā )·扎比）奧黛麗為了制止新的戰(zhàn)(??)爭爆發(fā)，必須組織“拉普(??)拉斯之箱(xiāng )”的交易。巴納吉在(??)數(shù)次幫助奧黛麗之后(hòu )，逐漸被她所吸引?！　‰S后，地球聯(lián)邦察覺了這起交易，并(bìng )進行軍事介入，工(gōng )業(yè)殖民地隨即化為一片火海。巴納吉和同伴一邊避難一邊尋找著奧黛麗，而出現(xiàn)在他面前的是比斯特財團的當(dāng)家卡迪阿斯·(??)比(??)斯特。奄奄一(yī )息的卡迪阿斯將出生的秘密告(gào )訴(sù )了巴納(??)吉(??)，并(??)且(qiě )將箱之鑰匙－－“機動戰(zhàn)士高達獨角獸”托付給他?！　‰S后，一場圍繞“拉普拉斯之箱”的戰(zhàn)爭開始了…………