一個(gè)名為(wéi )“阿(ā )卡姆”的民間組織受到遠(yuǎn)古文明留下的(de )訊息啟發(fā)(fā )而(??)成立。旨在保護(hù)及封印超古(gǔ )代文明的危險(xiǎn)遺跡。加入“阿卡姆”的特(tè )殊工作人員(??)，人們稱(??)之為(??)SPRIGGAN。其中實(shí)力(??)No.1的特工是一位叫作御神苗優(yōu)（森久保祥(??)太郎 配音）的(??)十七歲少年(nián )。在土耳其的一(yī )(??)次調(diào)查工作中，“阿卡姆”竟無意地發(fā)現(xiàn)了諾亞方舟。方舟隱藏著毀天(tiān )滅地的神秘力量，于是很多組織(??)都開始窺伺這個(gè)傳說中的遠(yuǎn)古遺跡。美國派出了半機(jī)械改造人小隊(duì)與“阿卡姆”展開激烈的遺跡爭奪戰(zhàn)。而其中一個(gè)(gè )以神自稱的改造人少年竟想私自利用挪亞方舟引發(fā)第二次(cì )洪水滅世(??)……御神苗優(yōu)是否能(??)夠阻止這一瘋狂的計(jì)(jì )劃呢？世界(??)將會走向滅(??)亡嗎？……